《藥師經(jīng)》全稱《藥師琉璃光如來本愿功德經(jīng)》，亦稱《藥師如來本愿功德經(jīng)》、《藥師本愿功德經(jīng)》、《藥師本愿經(jīng)》等，是佛教凈土宗的重要經(jīng)典之一。藥師如來法門依《藥師經(jīng)》建立，是深契時(shí)機(jī)、消災(zāi)免難，求獲人天福報(bào)的無上法門。

歷史上翻譯成漢文的《藥師經(jīng)》共有5種，但其中南北朝慧簡法師所譯的《藥師琉璃光經(jīng)》早已失傳，僅在古大藏經(jīng)目錄中載有篇名。因此，實(shí)際傳下來的《藥師經(jīng)》漢譯本只有4種，即：

1、東晉帛尸梨蜜多羅譯的《佛說灌頂拔除罪過生死得度經(jīng)》。此經(jīng)沒有單行本，附載《佛說灌頂大神咒經(jīng)》中。該經(jīng)《清藏》合訂為六卷，本經(jīng)即為其中最后一卷。

2、隋達(dá)摩笈多譯的《佛說藥師如來本愿經(jīng)》。

3、唐玄奘法師譯的《藥師琉璃光如來本愿功德經(jīng)》一卷。此即現(xiàn)今流通本所據(jù)的譯本，但現(xiàn)今流通本與玄奘原譯本略有不同，有增文兩節(jié)。即依東晉譯本補(bǔ)人八大菩薩名，又依唐義凈法師譯本補(bǔ)人藥師真言(神咒)及前后文二十余行。

4、唐義凈法師譯的《藥師琉璃光七佛如來本愿功德經(jīng)》二卷。《藥師經(jīng)》的前三種譯本大體一致，唯義凈譯本稍有不同，前者只提「藥師凈土」，義凈譯本則有「七佛凈土」，且譯有「藥師琉璃光如來大陀羅尼(神咒)」。

有關(guān)《藥師經(jīng)》的注疏，有唐窺基撰的《藥師經(jīng)疏》一卷；靖邁撰的《藥師經(jīng)疏》一卷；神泰撰的《藥師經(jīng)疏》一卷；遁倫撰的《藥師經(jīng)疏》一卷；憬與撰的《藥師經(jīng)疏》一卷；凈挺撰的《藥師經(jīng)燈焰》一卷；靈耀撰的《藥師經(jīng)直解》一卷，附梵文神咒；善珠撰的《藥師經(jīng)鈔》二卷；亮汰撰的《藥師經(jīng)纂解》四卷；新羅太賢撰的《藥師經(jīng)古跡》二卷等。

近代的太虛法師在浙江寧波阿育王寺曾講過一次《藥師經(jīng)》(1934年)；印順法師在臺灣省善導(dǎo)寺也講過一次(1954年)；演培法師又于新加坡佛教學(xué)院講過一次(1981年)。他們3人各有弟子記錄成的《講記》出版。此外，1934年上海佛學(xué)書局出版了何培著的《藥師經(jīng)旁解》。1990年11月，上海市佛教協(xié)會印出了金兆年、吳秋琴的《藥師經(jīng)白話解釋》。

《藥師經(jīng)》的全部經(jīng)文可分為三大部分，即「緣起分」、「正宗分」和「流通分」?！妇壠鸱帧箶⑹龇鹫f此經(jīng)的因緣。由此而引起開示全經(jīng)的主題，為正宗分。佛之說法，不但是為了當(dāng)時(shí)眼前的聽眾，而且還想到未來的聽眾，所以還要咐囑流通，使后人也聞此佛法，代代不絕，是為「流通分」?！刚诜帧故墙?jīng)文的主要部分，比較長，為宣講時(shí)解釋方便，根據(jù)經(jīng)文意思、內(nèi)容，分為十二節(jié)，每節(jié)列一小標(biāo)題。

以前有的法師在開講本經(jīng)時(shí)，于「緣起分」中還分「敘事證信」、「禮請起說」兩節(jié)，通常稱為「通序分」和「別序」。同時(shí)在緣起、正宗、流通的總分前與各小節(jié)之首，都還分別以甲、乙、丙、丁等。佛說一部大經(jīng)時(shí)是一氣呵成的。我們后人為了深入領(lǐng)會和便于記憶、誦念，才將經(jīng)文分為若干段落，但是如果分得太細(xì)太散，零零碎碎，就反而不能領(lǐng)悟經(jīng)中要旨，看不到經(jīng)文全貌，也就難以體味到佛祖講述本經(jīng)的基本精神與其境界了。

《藥經(jīng)琉璃光如來本愿功德經(jīng)》這12個(gè)字，包含了佛法中所說的教、理、行、果四方面內(nèi)容。「藥師琉璃光」這5個(gè)字是東方琉璃世界教主的別名，「藥師」兩字是喻佛的大悲，由于有這大悲的驅(qū)使，應(yīng)眾生的種種病，施予種種法藥，使眾生得以出離生死險(xiǎn)惡的苦海，所以被尊為大悲藥師。藥師不是現(xiàn)在指的藥師，藥師佛全稱藥師琉璃光如來，亦稱藥師如來、大醫(yī)王佛、醫(yī)王善逝、十二愿王等。為東方凈琉璃世界之教主。此佛于過去世行菩薩道時(shí)，曾發(fā)十二大愿，愿為眾生解除疾苦，使具足諸根，導(dǎo)人解脫。后依此愿而成佛，住凈琉璃世界，其國土莊嚴(yán)如極樂世界。

《藥師經(jīng)》和《法華經(jīng)》一樣，屬于大乘佛法中最上乘的秘密，是一切佛的秘密之教，不是普通密宗，是一切佛的最高秘密。從經(jīng)典文字上看來很容易懂，實(shí)際上你真不懂。我們要了解，大乘佛法告訴我們，這個(gè)宇宙無論哪一方位，所謂東方、西方、南方、北方、上方、下方等等，十方三世都有佛，處處有佛，每個(gè)人都因緣、業(yè)力、性情的不同，而產(chǎn)生各種學(xué)佛、念佛因緣的差別。根據(jù)《華嚴(yán)經(jīng)》的道理，一切佛都是毗盧遮那佛的化身，換何話說，十方三世諸佛都是一位佛，處處有佛，乃至一切眾生，也都是毗盧遮那佛的化身。

因此，以《華嚴(yán)經(jīng)》的密教道理而言，釋迦牟尼等等，都是毗盧遮那佛的化身，包括東方、西方、南方、北方、十方三世一切諸佛。因此，要真正了解《藥師經(jīng)》，必須先徹底了解《妙法蓮華經(jīng)》(簡稱《法華經(jīng)》)《法華經(jīng)》講到藥王菩薩，它與《藥師經(jīng)》意義相同。要了解《藥師經(jīng)》的奧秘，就必須先好好研究《法華經(jīng)》的《藥王品》。此外，也要把《大藏經(jīng)》中《佛說觀藥：王、藥上二菩薩經(jīng)》也抽出來研究。了解《藥師經(jīng)》，必須配合《法華經(jīng)》的四品一起研究：

1、《法華經(jīng)》第五品《藥草喻品》；

2、《法華經(jīng)》第七品《化城喻品》，

3、《法華經(jīng)》第十晶《法師品》；

4、《法華經(jīng)》第二十三品《藥王菩薩本事品》。

要把這四品參透，要知道每一部經(jīng)都是修持的法門，如果不了解這四品的真義，就永遠(yuǎn)不會懂得《藥師經(jīng)》的修持。

佛在說《法華經(jīng)》時(shí)有一譬喻，佛是大醫(yī)生，能醫(yī)眾生之病，能救眾生之苦。佛開的是什么藥方呢？中藥？西藥？佛在《藥草喻品》中說：大地一切都是藥。因?yàn)楸娚?，心病以及身病。整天不是頭昏昏，就是心里煩悶，身心兩病。你要吃哪一種藥才治得好？當(dāng)然心病仍要心藥醫(yī)，而心藥只有佛法。我們求佛、學(xué)佛，是為醫(yī)治身心的病而找這個(gè)藥，但始終沒能治好自己的病，因?yàn)樗幎紱]有吃對，病當(dāng)然不會治好。

佛教有這么一個(gè)故事，文殊菩薩叫他的弟子善財(cái)童子去采藥，善財(cái)童子抓一根草給師父說，你叫我去采藥，哪里不是藥？文殊菩薩言：善哉！善哉！對！對！到處都是藥，毒藥也可以治病，而且有些重病還非吃毒藥治不好。補(bǔ)藥，大家都認(rèn)為好，吃多了也會補(bǔ)死人的。例如，傷風(fēng)感冒吃高麗參等等補(bǔ)藥，常常都是這樣補(bǔ)死人的。然而，我們的身心之病，究竟要找哪一種藥才能治好呢？那就要求教藥師佛了！

藥師法是圓融世出世間之法，是圓通顯密之法；是釋迦、藥師、大日，非一非二，本師本尊一具之法；是般若空、般若不空雙顯之法；是法性、法相雙融之法；是曼殊室利、執(zhí)金剛對揚(yáng)之法；是了生脫死，即在生活中』了生死，以藥物為第一性、性空為第二性來認(rèn)識人生而改造人生，不離實(shí)際，不尚空談，現(xiàn)前腳下立地起修之法。

《藥師經(jīng)》是藥師法的說明，藥師法是藥師定的作用，而藥師定的本質(zhì)就是色、息、心法。亦即教人如何在生活中了生死，而又在了生死中生活。所以藥師經(jīng)法是教人生活做人之大法，是教人即身認(rèn)識人身人生而改造人身人生之大法。修密教者，修人道也。而修藥師法者，是正修人道，以人合人，以人合天，天人合一也。故藥師經(jīng)法，是人間佛教正信、正念、正知、正見、正定、正命之正法也。

如來禪以安般人手，都攝六根，較側(cè)重于息法；祖師禪以觀心為本體．較側(cè)重于心法；秘密以六大四曼二密為體相用，較側(cè)重于色法。故如來禪為破惑證真之禪，祖師禪為明心見性之禪，秘密禪為即身成佛之禪。人體有色、啟、心三大要素之分支，生活有飲食、呼吸、睡眠三大活動之需要，法門有如來、祖師、秘密三大體系之類別，禪定亦因三大法系而展開。藥師定者，融秘密禪修色之要，會如來禪修息之奧，通祖師禪修心之妙。定有境界，有行相，有果證，皆待實(shí)修實(shí)證·，憑空開口不得。以其在生活中實(shí)修實(shí)證，故日常做人做事，生活習(xí)慣，飲食起居，呼吸睡眠，舉手投足，起心動念，言語行為，心境意識，均為修藥師定之行境，所以會做人生活者，會通藥師法。

《藥師經(jīng)》之根本在十二大愿。言為心聲，愿為心師。世法做人之根本端在立志，佛法之根本首在發(fā)愿。圣賢講立志，菩薩講發(fā)愿，實(shí)質(zhì)一也。有藥師之十二大愿，才有琉璃光世界，心大世界大，心凈佛土凈，愿真誠就真也。人本具欲，心可發(fā)愿。愿之與欲，本體是一，用則有異。有我則欲，無我則愿；迷者是欲，覺者是愿；識者是欲，智者是愿；凡欲學(xué)藥師經(jīng)法者，必先立藥師之大愿，修藥師之大定，無我為人，凈心行愿。近代大德倡導(dǎo)人間佛教思想，就是希望人人發(fā)藥師愿，行藥師行，修藥師定，成藥師身，轉(zhuǎn)娑婆世界為人間凈土，轉(zhuǎn)成琉璃光，這就是藥師如來十二大愿之根本總愿。

清代玉琳國師曾說過，對于未能忘懷名利的人，未能深厭男女情欲、美食、欲望的人，如果要他們?nèi)バ蘖?xí)凈土往生法門，則往往因?yàn)楸娚硇迌敉炼鴧s心戀世間，終未得到多大的用處。如果人們要求不離欲而成佛智，則不如修習(xí)藥師佛的法門，來得簡單有效。修行者只要憑著信心，精進(jìn)不懈，久而久之，也定可以隨愿成就，救人祛病，延年益壽，而且更能于一切成就處直趨菩提，永不退轉(zhuǎn)，，又何樂而不為？