藥師經(jīng)典自《拔除過罪生死得度經(jīng)》以來，凡有五譯，以玄奘三藏所譯《藥師琉璃光如來本愿功德經(jīng)》為最流行，以義凈三藏所譯《藥師琉璃光七佛本愿功德經(jīng)》為最完整。吳老的《藥師經(jīng)法研究》一書，其釋義、講記、研究以凈師譯本為主而以奘師圓通顯密之法。是釋迦、藥師、大日，非一非二，本師本尊一具之法。是般若空、般若不空雙顯之法。是法性、法相雙融之法，是曼殊室利、執(zhí)金剛對揚之法。是了生脫死，即在生活中了生死，以藥物為第一性、性空為第二性來認(rèn)識人生而改造人生，不離實際，不尚空談，現(xiàn)前腳下立地起修之大法也。藥師法既不離世間法，故必會通世間自然科學(xué)、社會科學(xué)以為研究，能破除宗教之偶像、教條和迷信等等。藥師法既不離出世間法，故亦必會通佛法大小乘、顯密教以為研究，才能破除世間之小我、妄執(zhí)和邪見等等。至于藥師法的本質(zhì)就是藥師定?！端帋熃?jīng)》是藥師法的說明，藥師法是藥師定的作用，而藥師定的本質(zhì)就是色、息、心法。人為色息心之一具，修藥師定者，教人明乎自己色息心之所由具，以及如何用此色息心之所具而做頂天立地之人也。亦即教人如何在生活中了生死，而又在了生死中生活也。所以藥師經(jīng)法是教人生活做人之大法，是教人即生即身認(rèn)識人身人生而改造人身人生之大法也。釋迦為人間之本師，藥師為人道之本尊，大日為天道之本尊。修密教者，修人道也。而修藥師法者，是正修人道，以人合人，以人合天，天人合一也。故藥師經(jīng)法，是人間佛教正信正念、正知正見、正定正命之正法也。佛法三學(xué)，定為樞紐。就禪定自身性質(zhì)而言，能修者為人自身，而所修者亦為人自身，斯即以人自身而修人自身，顯見于外，密藏于內(nèi)，顯在其中，密亦在其中矣。能修者人，人為色息心之一具；所修者人，而人又為貪嗔癡之一體，轉(zhuǎn)貪睼癡之一體為戒定慧之一體，轉(zhuǎn)色身為琉璃光身，又在此色息心之一具。故禪定修法，總不外色法、息法、心法三門。此由人體自性而定，法爾如此，概莫能外。色息心三法具于一體，而一體又分色息心三法之用，三法相通而又法住法位。故三法雖融，卻以因地方法側(cè)重不同，而果地證得自然大異。佛法禪定，八萬四千法門，攝之不外如來禪、祖師禪、秘密禪三大類。

　　如來禪以安般入手，都攝六根，較側(cè)重于息法，祖師禪以觀心為本體，較側(cè)重于心法；秘密禪以六大四曼三密為體相用，較側(cè)重于色法。故如來禪為破惑證真之禪，祖師禪為明心見性之禪，秘密禪為即身成佛之禪。人體有色息心三大要素之分支，生活有飲食、呼吸、睡眠三大活動之需要，法門有如來、祖師、秘密三大體系之類別，禪定亦因三大法系而展開。藥師定者，融秘密禪修色之要，會如來禪修息之奧，通祖師禪修心之妙，以大食法（消化生理）修色，解決食色問題；以安般法（循環(huán)生理）修息，解決呼吸問題；以入寤法（大腦生理）修心，解決睡眠問題，實為現(xiàn)前做人做事之生活禪也。定有境界，有行相，有果證，皆待實修實證，憑空開口不得。以其在生活中實修實證，故日常做人做事，生活習(xí)慣，飲食起居，呼吸睡眠，舉手投足，起心動念，言語云為，心境意識，均為修藥師定之行境，所以會做人生活者，會通藥師法，而不會做人生活者，必不會藥師法，所以修學(xué)藥師經(jīng)法必需做人第一，學(xué)會生活。

　　《藥師經(jīng)》之根本在十二大愿。言為心聲，愿為心師。世法做人之根本端在立志，佛法修行之根本首在發(fā)愿。圣賢講立志，菩薩講發(fā)愿，實質(zhì)一也。心之所之曰志，心之所凝曰愿。行茲在茲，言茲在茲，念茲在茲，造次必如是，顛沛必如是，心境所凝，歷劫不斷，精誠所至，天地為開，是則為愿也。有藥師之十二大愿，才有琉璃光世界，心大世界大，心凈佛土凈、愿真成就真也。人本具欲，心可發(fā)愿。愿之與欲，本體是一，用則有異。有我則欲，無我則愿；迷則是欲，覺則是愿；識則是欲，智則是愿；業(yè)則是欲，密則是愿。清凈行欲，欲即是愿，貪嗔行愿，愿亦成欲。凡欲學(xué)藥師經(jīng)法者，必先立藥師之大愿，修藥師之大定，無我為人，凈心行愿，因行真實，果地不虛，層層藥師身，重重?zé)o盡意，必能以色身透法界，以法界透色身，現(xiàn)證藥師本尊，圓滿成就凈琉璃光世界也。

　　近代大德倡導(dǎo)人間佛教思想，就是希望人人發(fā)藥師愿，行藥師行，修藥師定，成藥師身，轉(zhuǎn)娑婆世界為人間凈土?，F(xiàn)前人間世，轉(zhuǎn)成琉璃光，這就是藥師如來十二大愿之根本總愿。他們應(yīng)化人間世界之東方中國，承上啟下，繼往開來，正是乘此根本大愿而垂跡的。蓋伊等均系藥師會上之菩薩，其指教弘揚藥師經(jīng)法以當(dāng)今日人間佛教之機，蓋有由也。